Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DQB1P01920 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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