Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms