Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSTPIP1O43586 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms