Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MSI1O43347 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MSI1O43347 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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