Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLGNO14967 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms