Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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