Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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