Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
MCRIP1C9JLW8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms