Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMGB1P1B2RPK0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms