Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID3CA6NKF2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID3CA6NKF2 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms