Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 ADCY4-204ENST00000554068 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 ZSCAN30-211ENST00000610712 3439 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A4D1N5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
A4D1N5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms