Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRAMEF22A3QJZ6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF22A3QJZ6 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms