Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F8A0AVK6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms