Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HPS5Q9UPZ3 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms