Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms