Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms