Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GORASP1Q9BQQ3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GORASP1Q9BQQ3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms