Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms