Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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ECHDC3Q96DC8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ECHDC3Q96DC8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ECHDC3Q96DC8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3Q96DC8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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