Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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