Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms