Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHMTQ93088 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms