Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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