Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LNX2Q8N448 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms