Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms