Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms