Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS9

USP39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39Q53GS9 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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USP39Q53GS9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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USP39Q53GS9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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USP39Q53GS9 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
USP39Q53GS9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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USP39Q53GS9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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USP39Q53GS9 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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USP39Q53GS9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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USP39Q53GS9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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