Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RRN3P1Q2M238 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms