Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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COL24A1Q17RW2 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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COL24A1Q17RW2 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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