Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NTRK2Q16620 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms