Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSU1Q15404 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms