Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NCF4Q15080 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms