Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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CUL4AQ13619 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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CUL4AQ13619 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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CUL4AQ13619 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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CUL4AQ13619 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL4AQ13619 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4AQ13619 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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