Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNW1Q13573 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SNW1Q13573 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms