Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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ITGB3BPQ13352 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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ITGB3BPQ13352 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB3BPQ13352 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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