Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHAF1AQ13111 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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