Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TROQ12816 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TROQ12816 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TROQ12816 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TROQ12816 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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