Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms