Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
LRP1Q07954 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms