Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CREMQ03060 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREMQ03060 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CREMQ03060 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms