Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK17Q00537 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms