Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX1P83916 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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