Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MCCD1P59942 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms