Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LOXL3P58215 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms