Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EPHB4P54760 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms