Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGA8P53708 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms