Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP3M2P53677 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms