Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KPNA1P52294 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms