Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NESP48681 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NESP48681 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NESP48681 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NESP48681 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NESP48681 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms