Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANGAP1P46060 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RANGAP1P46060 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms